RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585692.5

MFSD11-204, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 11, human

TSL 5

Gene MFSD11, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD11-204	ENST00000585692	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692		E5RGE8	158 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ACOX3	O15254	700 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ZW10	O43264	779 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	DUX1	O43812	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	RAD1	O60671	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PFDN1	O60925	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CLDN1	O95832	211 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	IDO1	P14902	403 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CYP2A7	P20853	494 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ATP4B	P51164	291 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GFER	P55789	205 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	NUP107	P57740	925 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PMP22	Q01453	160 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	NFATC2	Q13469	925 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ART3	Q13508	389 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ART5	Q96L15	291 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	NPAS2	Q99743	824 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CCT7	Q99832	543 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	FLNC	Q14315	2725 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692		A0A087WXM4	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692		A8MU76	341 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	MAGEB3	O15480	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CFLAR	O15519	480 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	PSMD3	O43242	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	VEGFD	O43915	354 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	CYTIP	O60759	359 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	MTX2	O75431	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	VAPB	O95292	243 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	EPO	P01588	193 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	GPX3	P22352	226 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	ADRA1A	P35348	466 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	HMGCL	P35914	325 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	OPRL1	P41146	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	OR3A3	P47888	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	SLC6A12	P48065	614 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	XG	P55808	180 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	STX5	Q13190	355 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	TMEM187	Q14656	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD11-204	ENST00000585692	TGFBI	Q15582	683 aa		4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms