RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 MT-ATP6P00846 226 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDELR2P33947 212 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTKP33981 857 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAPZA2P47755 286 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAMK2DQ13557 499 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 AGAP6Q5VW22 663 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA21Q7Z572 469 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 TREML1Q86YW5 311 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 MICU2Q8IYU8 434 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 HTRA1Q92743 480 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKRPQ9H9S5 495 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP8B1O43520 1251 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFNA14P01570 189 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHV4-39P01824 125 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACVR1BP36896 505 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 BIDP55957 195 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNK1Q13470 666 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 DTX2Q86UW9 622 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 C20orf196Q8IYI0 205 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MUC15Q8N387 334 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 PFN4Q8NHR9 129 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPP4Q96JB8 637 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CACNG6Q9BXT2 260 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NANSQ9NR45 359 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF13O43567 381 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIST1H2ABP04908 130 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFNGR1P15260 489 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUDT2P50583 147 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC7A2P52569 658 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 LIPEQ05469 1076 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MELKQ14680 651 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 PXKQ7Z7A4 578 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 BOD1Q96IK1 185 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MED13LQ71F56 2210 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 LY6G6DO95868 133 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CELA3BP08861 270 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CECR9P0C854 216 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 GYS2P54840 703 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 UGT2B15P54855 530 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPRL3Q12980 569 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 VHLLQ6RSH7 139 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NME4O00746 187 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSTA4O15217 222 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSX4O60224 188 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5F1O95221 314 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSNK1A1P48729 337 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NAAAQ02083 359 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MDP1Q86V88 176 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RHCGQ9UBD6 479 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms