RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 LRR1Q96L50 414 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TEX12Q9BXU0 123 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 AMBNQ9NP70 447 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CMC2Q9NRP2 79 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 FAM183AA6NL82 134 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 H0YC42 278 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 K7EM74 188 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PLPP3O14495 311 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 SEC14L5O43304 696 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 AKR7A3O95154 331 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 HPNP05981 417 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CD14P08571 375 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 HTR1AP08908 422 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CCDC159P0C7I6 412 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 C1QTNF9P0C862 333 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ATP6V1B1P15313 513 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 DIO1P49895 249 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 GFRA1P56159 465 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CLDN20P56880 219 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 OR2B6P58173 313 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 GABARAPL2P60520 117 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CXCR4P61073 352 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PIGFQ07326 219 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CRMP1Q14194 572 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 BORAQ6PGQ7 559 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 AHSA2Q719I0 299 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TRILQ7L0X0 811 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 FAM122BQ7Z309 247 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 GGNQ86UU5 652 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 SCAIQ8N9R8 606 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 Q96M85 177 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 KLHL15Q96M94 604 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 MED20Q9H944 212 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CHST11Q9NPF2 352 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CLN6Q9NWW5 311 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 SCOCQ9UIL1 159 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 U3KQE9 123 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CACNA1GO43497 2377 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 LAMA5O15230 3695 aa8.95□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 A0A0J9YW62 118 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ACOT7O00154 380 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 IMPA2O14732 288 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TNFSF11O14788 317 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 RGS13O14921 159 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 RNF13O43567 381 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 OR6A2O95222 327 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PMS2P2O95744 297 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ZNF3P17036 446 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 AHCYP23526 432 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 STARP49675 285 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 TMPRSS3P57727 454 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 SLC35A2P78381 396 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ZNF91Q05481 1191 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PUDPQ08623 228 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 BLMHQ13867 455 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-205ENST00000569899 CPOQ8IVL8 374 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms