RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 VCX3BQ9H321 246 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NELFAQ9H3P2 528 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHODLQ9H9P2 273 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDE1Q9NXR1 346 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 VAPAQ9P0L0 249 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCOCQ9UIL1 159 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPPA5A6NC42 116 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF212BA8MTL3 300 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRN3E7EW58 273 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R3G1 203 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R3H8 397 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 AIM2O14862 343 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC43A1O75387 559 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 VAMP5O95183 116 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAG2O95816 211 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HPRP00739 348 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BMP2P12643 396 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BMP4P12644 408 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLA-DOBP13765 273 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A16P16260 332 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK6Q00534 326 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAAAQ02083 359 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 REEP3Q6NUK4 255 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT73Q86Y46 540 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SVOPLQ8N434 492 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMYD1Q8NB12 490 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC38A4Q969I6 547 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2M2Q96R28 347 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 EMC6Q9BV81 110 aa6.24□□□□□ -1.41
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CRLF2Q9HC73 371 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR35Q9HC97 309 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 S100A14Q9HCY8 104 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CA10Q9NS85 328 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 MED29Q9NX70 200 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SELENONQ9NZV5 590 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FKBP7Q9Y680 259 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL6A5A8TX70 2615 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS13CQ709C8 3753 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF432O94892 652 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLA-HP01893 362 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BGLAPP02818 100 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4A8P0C604 315 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ETS2P15036 469 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4GALT1P15291 398 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKAR1BP31321 381 aa6.23□□□□□ -1.41
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MTPNP58546 118 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 DSCR9P59020 149 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 VLDLRP98155 873 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SELPLGQ14242 412 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1Q1Q15612 314 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADIPOQQ15848 244 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP51A1Q16850 503 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.23□□□□□ -1.41
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