RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 GABARAPH6UMI1 98 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GABARAPO95166 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RECKO95980 971 aa7.37□□□□□ -1.23
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