RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550331.1

NEK3-201, Transcript of NIMA related kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NEK3, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3-201ENST00000550331 CALCRP30988 508 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ARR3P36575 388 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 SLC18A1P54219 525 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 CLDN17P56750 224 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 EGR4Q05215 589 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 FADDQ13158 208 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 SQLEQ14534 574 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 CARTPTQ16568 116 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 GTDC1Q4AE62 458 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 LIPNQ5VXI9 398 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ATG16L1Q676U5 607 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 VHLLQ6RSH7 139 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 BBS10Q8TAM1 723 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 VPS33AQ96AX1 596 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 OXGR1Q96P68 337 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 DOK1Q99704 481 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 CENPHQ9H3R5 247 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.6□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TMEM120BA0PK00 339 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 A6NJY4 79 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 F8W735 103 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 STAMBPO95630 424 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TGFAP01135 160 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TACSTD2P09758 323 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 DAOP14920 347 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 PRKAR1BP31321 381 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 THBS4P35443 961 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 CHN2P52757 468 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TUBA1BP68363 451 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TUBA4AP68366 448 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 HGFACQ04756 655 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 RGNQ15493 299 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 NXNQ6DKJ4 435 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TUBA1AQ71U36 451 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TMEM123Q8N131 208 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 MIER2Q8N344 545 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 KDM8Q8N371 416 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ZNF786Q8N393 782 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 SVOPLQ8N434 492 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 OR6S1Q8NH40 331 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 SLC38A4Q969I6 547 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 OR2M2Q96R28 347 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 GPR35Q9HC97 309 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 BRD7Q9NPI1 651 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 RAB21Q9UL25 225 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 USP22Q9UPT9 525 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TGP01266 2768 aa6.59□□□□□ -1.35
NEK3-201ENST00000550331 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 A0A1B0GWA3 101 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 LRP5LA4QPB2 252 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 C5orf58C9J3I9 102 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 CLIC1O00299 241 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 UBDO15205 165 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 ALX3O95076 343 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 CELA3BP08861 270 aa6.58□□□□□ -1.36
NEK3-201ENST00000550331 KITP10721 976 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms