RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF726A6NNF4 738 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 LILRA1O75019 489 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 HLA-DOBP13765 273 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 AHCYP23526 432 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 GIFP27352 417 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 HTR2AP28223 471 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 PRKAR1BP31321 381 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 STX1BP61266 288 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 GALK2Q01415 458 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 PMS2P3Q13401 168 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 GCNT6Q5T4J0 391 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ULK3Q6PHR2 472 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MAVSQ7Z434 540 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT73Q86Y46 540 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 OR6N1Q8NGY5 312 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF2H4Q92759 462 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 HPS1Q92902 700 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC35B4Q969S0 331 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 EPYCQ99645 322 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SYT3Q9BQG1 590 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ASPNQ9BXN1 380 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 OCEL1Q9H607 264 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 C12orf10Q9HB07 376 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SPEF1Q9Y4P9 236 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A087WUJ7 227 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM129A0AVI4 362 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 M0R233 179 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB36O95755 333 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 HPRP00739 348 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TACSTD2P09758 323 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ETS2P15036 469 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 B4GALT1P15291 398 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 NR4A1P22736 598 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 AQP1P29972 269 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 CDK6Q00534 326 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 CAMK2DQ13557 499 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MFSD13AQ14CX5 517 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM123Q8N131 208 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 C1orf159Q96HA4 380 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ULBP2Q9BZM5 246 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MED29Q9NX70 200 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 DUSP13Q9UII6 198 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 FZR1Q9UM11 496 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 PLCE1Q9P212 2302 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRN3E7EW58 273 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MS4A18H0YCH9 400 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SYNGR3O43761 229 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TPST1O60507 370 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 OR6A2O95222 327 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ITGA2P17301 1181 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 ALDH3B1P43353 468 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 GIPRP48546 466 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 CDH15P55291 814 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB1AP62820 205 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 RIN1Q13671 783 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 OR1Q1Q15612 314 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MS4A18Q3C1V0 323 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 REEP3Q6NUK4 255 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 COMTD1Q86VU5 262 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SNX32Q86XE0 403 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TXNDC15Q96J42 360 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-205ENST00000549039 METRNQ9UJH8 293 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms