RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547201.5

USP25-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 757 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-209ENST00000547201 A0A1W2PPR1 153 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ERICH4A6NGS2 130 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 LIPT2A6NK58 231 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ENO4A6NNW6 628 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 VSTM5A8MXK1 200 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 H3BNX3 289 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 M0R129 80 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SYT5O00445 386 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 FAM20BO75063 409 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SEC14L2O76054 403 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SOX30O94993 753 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 AGR2O95994 175 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TFPIP10646 304 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GP1BBP13224 206 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PRF1P14222 555 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CPN1P15169 458 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PGCP20142 388 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 BMP5P22003 454 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ANOS1P23352 680 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ACVR2AP27037 513 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 LCN1P31025 176 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SLC1A3P43003 542 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GPR4P46093 362 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 DIO1P49895 249 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RUNX1T1Q06455 604 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SELENBP1Q13228 472 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 VEZF1Q14119 521 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MELKQ14680 651 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ODF1Q14990 250 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PDCD1Q15116 288 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR7A5Q15622 319 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CT83Q5H943 113 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 HBMQ6B0K9 141 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 LCN8Q6JVE9 175 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 C16orf89Q6UX73 402 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GRINAQ7Z429 371 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TMEM99Q8N816 258 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ZIC4Q8N9L1 334 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR52J3Q8NH60 311 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RNF128Q8TEB7 428 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CANT1Q8WVQ1 401 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SEPHS2Q99611 448 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PSD2Q9BQI7 771 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 LRRK2Q5S007 2527 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 AKAP9Q99996 3911 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TRAV27A0A087WT01 109 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 A0A087WUJ7 227 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 A0A087WUU8 490 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 WIPF3A6NGB9 483 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 H7C1C5 153 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 FAAHO00519 579 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ADAMDEC1O15204 470 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GYG2O15488 501 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TIPRLO75663 272 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SERPINI2O75830 405 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 TOX4O94842 621 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GPANK1O95872 356 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ACTL6AO96019 429 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 NPPAP01160 153 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CGAP01215 116 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PNMTP11086 282 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 FPR1P21462 350 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 CHMP24386 653 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms