RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542142.1

MMP17-208, Transcript of matrix metallopeptidase 17, human

TSL 4

Gene MMP17, Length 758 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MMP17-208	ENST00000542142	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MED29	Q9NX70	200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SERPINI2	O75830	405 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ATE1	O95260	518 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	IFNGR1	P15260	489 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HOXC12	P31275	282 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	IST1	P53990	364 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	KEAP1	Q14145	624 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LRR1	Q96L50	414 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142		A0A1W2PR80	420 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CD3E	P07766	207 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	IFI30	P13284	250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ITGA2	P17301	1181 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RHCE	P18577	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PRPS1	P60891	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ACKR1	Q16570	336 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ABCA4	P78363	2273 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142		A0A087WUU8	490 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142		M0R3G1	203 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	CLOCK	O15516	846 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	WNT11	O96014	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	PLAU	P00749	431 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	SEMG1	P04279	462 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF83	P51522	516 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	BID	P55957	195 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	VLDLR	P98155	873 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	PRKCD	Q05655	676 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	DGCR6	Q14129	220 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142		V9GYQ6	96 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142		A0A1W2PRG6	482 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MMP17-208	ENST00000542142	BCL10	O95999	233 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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