RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM163Q8TC26 289 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q96MT0 163 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EMC6Q9BV81 110 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED29Q9NX70 200 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CACNA1AO00555 2505 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35F4A4IF30 521 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM183AA6NL82 134 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR171O14626 319 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENTPD6O75354 484 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AQP8O94778 261 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNDC12O95881 172 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TGM6O95932 706 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCGR2AP12318 317 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMO3P31513 532 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TDGF1P3P51864 188 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBPJQ06330 500 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDK5R2Q13319 367 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITGADQ13349 1161 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAMK2DQ13557 499 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRMP1Q14194 572 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC17A1Q14916 467 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POU4F3Q15319 338 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CARD17Q5XLA6 110 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LEG1Q6P5S2 330 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM122BQ7Z309 247 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPOQ8IVL8 374 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF786Q8N393 782 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYT14Q8NB59 555 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABHD3Q8WU67 409 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASB10Q8WXI3 467 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRR1Q96L50 414 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NMNAT3Q96T66 252 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RERGLQ9H628 205 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED20Q9H944 212 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CALHM2Q9HA72 323 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FANCFQ9NPI8 374 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMC2Q9NRP2 79 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EMC3Q9P0I2 261 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF175Q9Y473 711 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNTNA6NMZ2 147 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF716A6NP11 495 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H7C1C5 153 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R3G1 203 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRRG2O14669 202 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM20BO75063 409 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR1O75083 606 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHG1P01857 330 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHMP01871 453 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YES1P07947 543 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EDN3P14138 238 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GABRA1P14867 456 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTGER4P35408 488 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPAP49450 140 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC16A1P53985 500 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms