RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SHC2P98077 582 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TGM3Q08188 693 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SSX9Q7RTT3 188 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MMP21Q8N119 569 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ARL14Q8N4G2 192 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GW55 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CCR7P32248 378 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GGACTQ9BVM4 153 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4Q9UBX2 424 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LNP1A1A4G5 178 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RPA2P15927 270 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PTNP21246 168 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 POU3F4P49335 361 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RNF212Q495C1 297 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2E3Q969T4 207 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PR77 199 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MGMTP16455 207 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PSMA3P25788 255 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PDHA2P29803 388 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ACSM1Q08AH1 577 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PEA15Q15121 130 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DERL3Q96Q80 235 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SPINT1O43278 529 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ADH6P28332 368 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CD96P40200 585 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TCF15Q12870 199 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 REEP3Q6NUK4 255 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF546Q86UE3 836 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IFI44Q8TCB0 444 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf79Q96F83 325 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 COX14Q96I36 57 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ARGFXA6NJG6 315 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DBX1A6NMT0 343 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RAD1O60671 282 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LILRB5O75023 590 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IGHA1P01876 353 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UBBP0CG47 229 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms