RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 CASP8Q14790 479 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CHI3L2Q15782 390 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GSTA3Q16772 222 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GPAT4Q86UL3 456 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 ZBTB18Q99592 522 aa9.52□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.52□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 NUP50Q9UKX7 468 aa9.52□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 FAAHO00519 579 aa9.51□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 GPIP06744 558 aa9.51□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 GATA3P23771 443 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CRYBB2P43320 205 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SLC1A6P48664 564 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 COPZ1P61923 177 aa9.51□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 FUT5Q11128 374 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 OR7A5Q15622 319 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 KRT71Q3SY84 523 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TMEM225Q6GV28 225 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 NIPAL3Q6P499 406 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZPA2 131 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CROCCP2Q86T23 111 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 KDM8Q8N371 416 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CALML5Q9NZT1 146 aa9.51□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 RAB21Q9UL25 225 aa9.51□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.51□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 SCN2BO60939 215 aa9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 CXCR1P25024 350 aa9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 REP15Q6BDI9 236 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 OGFOD2Q6N063 350 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 C16orf87Q6PH81 154 aa9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 SLC25A28Q96A46 364 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RAB39BQ96DA2 213 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GPA33Q99795 319 aa9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 GPR35Q9HC97 309 aa9.5□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 DUSP13Q9UII6 198 aa9.5□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 A0A096LPI6 279 aa9.49□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 C17orf100A8MU93 164 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 HMGN4O00479 90 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ITM2AO43736 263 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 C1QCP02747 245 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PCGF2P35227 344 aa9.49□□□□□ -0.89
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