RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF4	P43489	277 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RDH10	Q8IZV5	341 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ABCA3	Q99758	1704 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GLCE	O94923	617 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	THBS1	P07996	1170 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HBQ1	P09105	142 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF35	P13682	527 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ST6GAL1	P15907	406 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HTR2C	P28335	458 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CD6	P30203	668 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KIR2DL3	P43628	341 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TPMT	P51580	245 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SRY	Q05066	204 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CAMK2D	Q13557	499 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ARL11	Q969Q4	196 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SVIL	O95425	2214 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FITM1	A5D6W6	292 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SURF4	O15260	269 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KCNK2	O95069	426 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PAPLN	O95428	1278 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DIRAS3	O95661	229 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PDGFA	P04085	211 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		P04436	131 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CEACAM5	P06731	702 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF28	P17035	718 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CAMLG	P49069	296 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CAV2	P51636	162 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PPP2CB	P62714	309 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PPP2CA	P67775	309 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP8	Q13202	625 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TNK1	Q13470	666 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RUNX2	Q13950	521 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MEF2D	Q14814	521 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GIMAP5	Q96F15	307 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BORCS8	Q96FH0	119 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	APC2	O95996	2303 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GABRR1	P24046	479 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BTG1	P62324	171 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	INSL4	Q14641	139 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SSX1	Q16384	188 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM240	Q5SV17	173 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MARCH3	Q86UD3	253 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	STAC	Q99469	402 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GLTP	Q9NZD2	209 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	P2RY10	O00398	339 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SYNGR4	O95473	234 aa		7.4	□□□□□ -1.22

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