RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HSH2DQ96JZ2 352 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 FKRPQ9H9S5 495 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 DLL4Q9NR61 685 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 RHCGQ9UBD6 479 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35F4A4IF30 521 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 M0R3G1 203 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF682O95780 498 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINA1P01009 418 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNA14P01570 189 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT1P19526 365 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDX6P30041 224 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN1AP38936 164 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TGFBR3Q03167 851 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMK2DQ13557 499 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM108Q6UXF1 575 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM171Q8WVE6 324 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PRRC1Q96M27 445 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 CRLF2Q9HC73 371 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NANSQ9NR45 359 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 MTORP42345 2549 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 E7EQL1 145 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 UMPSP11172 480 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CD99P14209 185 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNGR1P15260 489 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 BIDP55957 195 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CBLL1Q75N03 491 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PXKQ7Z7A4 578 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR137CQ8N3F9 429 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 BOD1Q96IK1 185 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 GSX2Q9BZM3 304 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 DYNC1I1O14576 645 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 FFAR1O14842 300 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTA4O15217 222 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 MT-ND1P03886 318 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CELA3BP08861 270 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PTAFRP25105 342 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPS1P60891 318 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A25Q6T423 547 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SSX8Q7RTT4 187 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM239Q8WW34 195 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM162AQ96A26 154 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 NOX3Q9HBY0 568 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ZANQ9Y493 2812 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF13O43567 381 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7A10O76100 309 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CD8AP01732 235 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 Q96MF0 132 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ADA2Q9NZK5 511 aa16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms