RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.54□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 ZNF563Q8TA94 476 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 HTRA1Q92743 480 aa6.54□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.54□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 PLCE1Q9P212 2302 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0J9YW62 118 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1B0GWA3 101 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 ZNF682O95780 498 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 SEMG1P04279 462 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 CADM2Q8N3J6 435 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 TMEM234Q8WY98 164 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 FAM168AQ92567 244 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 FAM162AQ96A26 154 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 ARL5BQ96KC2 179 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 MCHR1Q99705 422 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 C12orf49Q9H741 205 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.53□□□□□ -1.36
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C9orf135-204ENST00000495399 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0B4J2E0 115 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1B0GX12 115 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 J3KTA2 159 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 EBAG9O00559 213 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 TNFSF11O14788 317 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 FFAR1O14842 300 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 ADAMDEC1O15204 470 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 FMO6PO60774 539 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-204ENST00000495399 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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