RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	ALG2	Q9H553	416 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM28-208	ENST00000495327	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327		E7EQL1	145 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	NME4	O00746	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SNX3	O60493	162 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CD8A	P01732	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ADORA3	P0DMS8	318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SLC7A2	P52569	658 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SEC24C	P53992	1094 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ATP5J2	P56134	94 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SELENOW	P63302	87 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ZP4	Q12836	540 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	DEF8	Q6ZN54	512 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	NANS	Q9NR45	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	MED29	Q9NX70	200 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	OR6A2	O95222	327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CH25H	O95992	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	MT-ND1	P03886	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	INHBB	P09529	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	DRD4	P21917	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	PRDX6	P30041	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	LSP1	P33241	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	TTK	P33981	857 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CDKN1A	P38936	164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	OR1E2	P47887	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	NUDT2	P50583	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	LIPE	Q05469	1076 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	LZIC	Q8WZA0	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	PRRC1	Q96M27	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CR1	P17927	2039 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327		A0A096LPE4	126 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327		M0R3G1	203 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	AHCY	P23526	432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	GSK3B	P49841	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	UGT2B15	P54855	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	MUC15	Q8N387	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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