RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492698.1

LAMA5-211, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 3

Gene LAMA5, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-211ENST00000492698 SLC1A3P43003 542 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF83P51522 516 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 LGALS3BPQ08380 585 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TNK1Q13470 666 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 NRF1Q16656 503 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OR2T5Q6IEZ7 315 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CASP12Q6UXS9 341 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CARM1Q86X55 608 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CADM2Q8N3J6 435 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TMEM99Q8N816 258 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OR2T29Q8NH02 315 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 PIGXQ8TBF5 258 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 PROX1Q92786 737 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 FBXW5Q969U6 566 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SLC29A1Q99808 456 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CIB1Q99828 191 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 WFDC6Q9BQY6 131 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 VCX3BQ9H321 246 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 EMC3Q9P0I2 261 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 LRRC42Q9Y546 428 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZANQ9Y493 2812 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OR5H1A6NKK0 313 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 PDLIM1O00151 329 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SOCS2O14508 198 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ABCD4O14678 606 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF208O43345 1280 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 THBS1P07996 1170 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ITGA2P17301 1181 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 PCSK6P29122 969 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SLC35A1P78382 337 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SLC17A1Q14916 467 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OR7A5Q15622 319 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 LIN52Q52LA3 116 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 WDR31Q8NA23 367 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 EME1Q96AY2 570 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 DDIT4LQ96D03 193 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF347Q96SE7 839 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ARHGDIGQ99819 225 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 MALT1Q9UDY8 824 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.54□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CIB4A0PJX0 185 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 LIPT2A6NK58 231 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 E7EQL1 145 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 J3KTA2 159 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 GNGT2O14610 69 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 DNPH1O43598 174 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 IGHV4-39P01824 125 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 IFNW1P05000 195 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 RHCEP18577 417 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 IDUAP35475 653 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ACVR1BP36896 505 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 HTR3AP46098 478 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 P2RY4P51582 365 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CDH11P55287 796 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 GABRA6Q16445 453 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SVOPLQ8N434 492 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CBR4Q8N4T8 237 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 C3orf49Q96BT1 292 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 PRR14Q9BWN1 585 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 NGBQ9NPG2 151 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 ASB6Q9NWX5 421 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMA5-211ENST00000492698 INAFM1C9JVW0 142 aa11.52□□□□□ -0.57
LAMA5-211ENST00000492698 RNF223E7ERA6 249 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms