RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB6Q15916 424 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR4Q16378 134 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPK6Q16659 721 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 DCST2Q5T1A1 773 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LIN9Q5TKA1 542 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 WSCD1Q658N2 575 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPPQ6IPU0 288 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC8BQ6P9F7 803 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CBLN3Q6UW01 205 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPUQ71F23 418 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 VASH2Q86V25 355 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ALLCQ8N6M5 410 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 NANPQ8TBE9 248 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC110Q8TBZ0 833 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS39Q96JC1 886 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ZIM3Q96PE6 472 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP2S1Q96SQ9 504 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 RIT2Q99578 217 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LXNQ9BS40 222 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 Q9H3A6 140 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CAB39LQ9H9S4 337 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR3Q9UBC9 169 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 MMP17Q9ULZ9 603 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CELA1Q9UNI1 258 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCG2Q9UNQ0 655 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CHMP2BQ9UQN3 213 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE10AQ9Y233 779 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PPIAL4AQ9Y536 164 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 U3KQV3 271 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 SDK2Q58EX2 2172 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 MED13Q9UHV7 2174 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP2.31□□□□□ -2.041e-6■■□□□ 13.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SPG11Q96JI7 2443 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 APCP25054 2843 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 RP1P56715 2156 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 F8P00451 2351 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 DHRS7CA6NNS2 312 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ENP7 123 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 FCN1O00602 326 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 GPX5O75715 221 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CTDNEP1O95476 244 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNB1P01574 187 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 HBQ1P09105 142 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 GIMD1P0DJR0 217 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CALCBP10092 127 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 TNNI3P19429 210 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 VDAC1P21796 283 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ADORA2BP29275 332 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 YWHABP31946 246 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 STX17P56962 302 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMC5P62195 406 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 NUCB2P80303 420 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 KDSRQ06136 332 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5M10Q6IEU7 315 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSM5Q6NUN0 579 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 FRA10AC1Q70Z53 315 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 DPY19L4Q7Z388 723 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CMTM8Q8IZV2 173 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 HAVCR1Q96D42 359 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 NUS1Q96E22 293 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP170P1Q96L14 293 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC30A2Q9BRI3 323 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 TEKT3Q9BXF9 490 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 NMUR2Q9GZQ4 415 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 DPH5Q9H2P9 285 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CLMPQ9H6B4 373 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR76Q9H967 626 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCB10Q9NRK6 738 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 NRBP2Q9NSY0 501 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 HPF1Q9NWY4 346 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 U3KQA8 63 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP4O75096 1905 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 CLDN3O15551 220 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GAT3O94766 335 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 LYPLA2O95372 231 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-211ENST00000489450 F10P00742 488 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms