RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PYURF	Q96I23	114 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRC1	Q96M27	445 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424		Q96MF0	132 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPN	Q9BXN1	380 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM15	Q9C019	465 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RCE1	Q9Y256	329 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SHISA9	B4DS77	424 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CLOCK	O15516	846 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR7A3	O95154	331 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT11	O96014	354 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HEXA	P06865	529 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGA5	P08648	1049 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	BNIP1	Q12981	228 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FXN	Q16595	210 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RRM2B	Q7LG56	351 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PERP	Q96FX8	193 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	POM121	Q96HA1	1249 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		15.17	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6A2	O95222	327 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MT-ATP6	P00846	226 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CD40	P25942	277 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5J2	P56134	94 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM11A	P58511	58 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPS1	P60891	318 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1RL1	Q01638	556 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	EGR4	Q05215	589 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAM2	Q15035	370 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PGGHG	Q32M88	737 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AGAP6	Q5VW22	663 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF544	Q6NX49	715 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		15.16	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCD4	O14678	606 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD51D	O75771	328 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SOD3	P08294	240 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GPAT4	Q86UL3	456 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK20	Q8IZL9	346 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR31	Q8NA23	367 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TAAR8	Q969N4	342 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB9	Q96DX5	294 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OXGR1	Q96P68	337 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SMR3A	Q99954	134 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FKRP	Q9H9S5	495 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MED31	Q9Y3C7	131 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		15.15	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	EBAG9	O00559	213 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE5A	O76074	875 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-9	P01782	118 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF43	P17038	809 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RHCE	P18577	417 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH11	P55287	796 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CBX1	P83916	185 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PMS2P3	Q13401	168 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAI	Q8N9R8	606 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM239	Q8WW34	195 aa		15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NANS	Q9NR45	359 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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