RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TMEM120BA0PK00 339 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 VSTM2BA6NLU5 285 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 EFCAB7A8K855 629 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 GOSR2O14653 212 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 HSBP1O75506 76 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 GJB5O95377 273 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 OPRD1P41143 372 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CCNG1P51959 295 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ERVK-25P63136 954 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SLC10A1Q14973 349 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 C6orf183Q5T699 404 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 NRMQ8IXM6 262 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 LIX1Q8N485 282 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ACOT4Q8N9L9 421 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SUN5Q8TC36 379 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ASB9Q96DX5 294 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 HSFY1Q96LI6 401 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 RANBP9Q96S59 729 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 MFFQ9GZY8 342 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 TREM1Q9NP99 234 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 QPCTLQ9NXS2 382 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 PLLPQ9Y342 182 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CLASP1Q7Z460 1538 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 RAB19A4D1S5 217 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 A8MUA0 341 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 NDUFAB1O14561 156 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B6O14756 317 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 AIREO43918 545 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 OR7A10O76100 309 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ALDOBP05062 364 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CLTAP09496 248 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CT62P0C5K7 136 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ZNF853P0CG23 659 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CT45A10P0DMU9 189 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 LAMP1P11279 417 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ZNF43P17038 809 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 FASP25445 335 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 DCKP27707 260 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 HTR1FP30939 366 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 FOXN2P32314 431 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 OR1D4P47884 311 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 GPM6AP51674 278 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K7CLP57077 242 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP10-12P60413 245 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 PAX2Q02962 417 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CHRNB3Q05901 458 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SELENBP1Q13228 472 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SLAQ13239 276 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 GPR176Q14439 515 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 STUMQ69YW2 141 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SPINK14Q6IE38 97 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SPATA24Q86W54 205 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 NAXDQ8IW45 347 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 NDNFQ8TB73 568 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 PYROXD1Q8WU10 500 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms