RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CDK20	Q8IZL9	346 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR2M2	Q96R28	347 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	C1orf21	Q9H246	121 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		15.62	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	SLC35F4	A4IF30	521 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902		M0R3G1	203 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	KLF4	O43474	513 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	BID	P55957	195 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	CAMK2D	Q13557	499 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	GABRA6	Q16445	453 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	CDH24	Q86UP0	819 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	DHFR2	Q86XF0	187 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	C7orf34	Q96L11	122 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	SEPHS2	Q99611	448 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	CAD	P27708	2225 aa		15.61	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WUU8	490 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PDLIM1	O00151	329 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZNF432	O94892	652 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PRSS23	O95084	383 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	IGF2	P01344	180 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	F13B	P05160	661 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	FABP3	P05413	133 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1B2	P21281	511 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	AQP2	P41181	271 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	NR1H2	P55055	460 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZP4	Q12836	540 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR52J3	Q8NH60	311 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	LRGUK	Q96M69	825 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	MUS81	Q96NY9	551 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PIP5K1A	Q99755	562 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	MUC13	Q9H3R2	512 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	LIME1	Q9H400	295 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	EDAR	Q9UNE0	448 aa		15.6	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRG6	482 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	MAK	P20794	623 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	SPIB	Q01892	262 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PRKCD	Q05655	676 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	MELK	Q14680	651 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	LAPTM4A	Q15012	233 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	LINGO2	Q7L985	606 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	TMEM123	Q8N131	208 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	CRLF2	Q9HC73	371 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902	DSCAM	O60469	2012 aa		15.59	■□□□□ 0.09
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRQ8	180 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CLOCK	O15516	846 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	GADD45G	O95257	159 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	BCL10	O95999	233 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	GPR4	P46093	362 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CSNK1A1	P48729	337 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF83	P51522	516 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SMIM11A	P58511	58 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MS4A2	Q01362	244 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	DGCR6	Q14129	220 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MTX3	Q5HYI7	312 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OAF	Q86UD1	273 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR51A7	Q8NH64	312 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08

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