RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 WDFY1Q8IWB7 410 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CYB561A3Q8NBI2 242 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF519Q8TB69 540 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ROBO4Q8WZ75 1007 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NOX1Q9Y5S8 564 aa21.64■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 A0A1B0GTH9 108 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ENTPD6O75354 484 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.051e-7■■■□□ 15.9
NME4-209ENST00000460297 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ITGADQ13349 1161 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 MELKQ14680 651 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 OCLNQ16625 522 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 EMC4Q5J8M3 183 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SLC35D2Q76EJ3 337 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CPOQ8IVL8 374 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 UEVLDQ8IX04 471 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TEX19Q8NA77 164 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NPEPL1Q8NDH3 523 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TXNDC15Q96J42 360 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NMNAT3Q96T66 252 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 DDOQ99489 341 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 HCAR1Q9BXC0 346 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PRDM14Q9GZV8 571 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SLC25A18Q9H1K4 315 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 FN3KQ9H479 309 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 MED29Q9NX70 200 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CAMK2AQ9UQM7 478 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NPIPB13A6NJU9 1138 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NPIPB4C9JG80 1138 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 IFNGP01579 166 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF3P17036 446 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TEKQ02763 1124 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PTP4A1Q93096 173 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 GPR137Q96N19 417 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 MED20Q9H944 212 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CLN6Q9NWW5 311 aa21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 GTF3C1Q12789 2109 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NPIPA2E9PIF3 369 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NPIPA3F8WFD2 350 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SLC1A7O00341 560 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 XPNPEP2O43895 674 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 VAMP5O95183 116 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF43P17038 809 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ACVR1BP36896 505 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NUDT6P53370 316 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SLC17A1Q14916 467 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 AADACL4Q5VUY2 407 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PLBD1Q6P4A8 553 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 GHDCQ8N2G8 530 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 BBS1Q8NFJ9 593 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ASB10Q8WXI3 467 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 AMBNQ9NP70 447 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ATRXP46100 2492 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 OR6C68A6NDL8 312 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 BCL10O95999 233 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CRHBPP24387 322 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 DAP3P51398 398 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CXCR4P61073 352 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 RUNX1T1Q06455 604 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PON3Q15166 354 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 POU4F3Q15319 338 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 FCRLAQ7L513 359 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 FGD2Q7Z6J4 655 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF566Q969W8 418 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SARAFQ96BY9 339 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 USP24Q9UPU5 2620 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF716A6NP11 495 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 H7C1C5 153 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 LYNP07948 512 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 LCN6P62502 163 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 MEDAGQ5VYS4 303 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 LEG1Q6P5S2 330 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 OR9K2Q8NGE7 335 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 FNDC9Q8TBE3 224 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 OTULINQ96BN8 352 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms