RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PBRM1-218ENST00000458294 LRR1Q96L50 414 aa22.71■■□□□ 1.23
PBRM1-218ENST00000458294 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PBRM1-218ENST00000458294 THAP1Q9NVV9 213 aa22.71■■□□□ 1.23
PBRM1-218ENST00000458294 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.71■■□□□ 1.23
PBRM1-218ENST00000458294 BMP2P12643 396 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 PRKAR1BP31321 381 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 GLRXP35754 106 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RGNQ15493 299 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ELFN2Q5R3F8 820 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 REP15Q6BDI9 236 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF627Q7L945 461 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.7■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1B0GWA3 101 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 NUDT7P0C024 238 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CD79AP11912 226 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF35P13682 527 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 FADDQ13158 208 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MSMPQ1L6U9 139 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 HHATQ5VTY9 493 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 OR6S1Q8NH40 331 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A3Q96HJ5 214 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF75AQ96N20 296 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CENPHQ9H3R5 247 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 OCEL1Q9H607 264 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 NOX1Q9Y5S8 564 aa22.69■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A18H0YCH9 400 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 KITP10721 976 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ETS2P15036 469 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ACHEP22303 614 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RUNX1T1Q06455 604 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SCGB2A2Q13296 93 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CARD17Q5XLA6 110 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SNX32Q86XE0 403 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CLDND2Q8NHS1 167 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MAL2Q969L2 176 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 A0A087WUJ7 227 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 C5orf58C9J3I9 102 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CLIC1O00299 241 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 TFP02787 698 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CBLP22681 906 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 CFPP27918 469 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 HTR2AP28223 471 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RPS23P62266 143 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ULK3Q6PHR2 472 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SCAIQ8N9R8 606 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 GTF2H4Q92759 462 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RDH5Q92781 318 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM186Q96B77 213 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 EMC6Q9BV81 110 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa22.67■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 VENTXO95231 258 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 HPRP00739 348 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 HPXP02790 462 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 HLA-DOBP13765 273 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 GALK2Q01415 458 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 PIGFQ07326 219 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 FXNQ16595 210 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 EPYCQ99645 322 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 SYT3Q9BQG1 590 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ASPNQ9BXN1 380 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 HIF1ANQ9NWT6 349 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 FBXL3Q9UKT7 428 aa22.66■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 RAB36O95755 333 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MSMBP08118 114 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 B4GALT1P15291 398 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 COL8A2P25067 703 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM33P57088 247 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms