RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448183.6

NEDD9-204, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD9, Length 4,934 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-204ENST00000448183 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CDC14CA4D256 554 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 M0QYG6 137 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SIX6O95475 246 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 BCKDHBP21953 392 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 REEP5Q00765 189 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 OPN5Q6U736 354 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 YIPF5Q969M3 257 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF566Q969W8 418 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ADAM10O14672 748 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SUSD5O60279 629 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CBX7O95931 251 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF728P0DKX0 622 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CD53P19397 219 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SRMP19623 302 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 DUSP6Q16828 381 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 TMUB2Q71RG4 321 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF511Q8NB15 262 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 FAM3CQ92520 227 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 DUSP21Q9H596 190 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 KNL1Q8NG31 2342 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 LPLP06858 475 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CEBPBP17676 345 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 THBS3P49746 956 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SEMA3BQ13214 749 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 MFAP5Q13361 173 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 MEP1BQ16820 701 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SLC36A2Q495M3 483 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SYT14P1Q58G82 188 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 OR10K2Q6IF99 312 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SSX9Q7RTT3 188 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 RAB22AQ9UL26 194 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 MED16Q9Y2X0 877 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ALS2Q96Q42 1657 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 C20orf202A1L168 122 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 A6NL46 340 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 GABARAPH6UMI1 98 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 TAPBPO15533 448 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CBR1P16152 277 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 HTR5AP47898 357 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 HCCSP53701 268 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ERVFC1P60507 584 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CAMK2BQ13554 666 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 ERV3-1Q14264 604 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 MORN1Q5T089 497 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 BADQ92934 168 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 LURAP1Q96LR2 239 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 CASD1Q96PB1 797 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD9-204ENST00000448183 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms