RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.19■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.19■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 NOX1Q9Y5S8 564 aa18.19■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa18.18■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 NPR2P20594 1047 aa18.17■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 IL1RL1Q01638 556 aa18.17■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 PUDPQ08623 228 aa18.17■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 PHYHD1Q5SRE7 291 aa18.17■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 FAM166AQ6J272 317 aa18.17■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF613Q6PF04 617 aa18.17■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 VHLLQ6RSH7 139 aa18.17■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa18.17■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 THBS4P35443 961 aa18.16■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 CDH12P55289 794 aa18.16■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00114Q6XXX2 140 aa18.16■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 DPP10Q8N608 796 aa18.16■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf65Q8NCR3 313 aa18.16■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 FOXN4Q96NZ1 517 aa18.16■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.16■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGDIGQ99819 225 aa18.16■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 RNF217Q8TC41 542 aa18.15■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 DYDC1Q8WWB3 177 aa18.15■□□□□ 0.5
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.15■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 NOX3Q9HBY0 568 aa18.15■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 MED29Q9NX70 200 aa18.15■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 STAB1Q9NY15 2570 aa18.15■□□□□ 0.5
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM129A0AVI4 362 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PLPP3O14495 311 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
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