RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423160.2

SCN4B-203, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SCN4B, Length 3,969 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-203ENST00000423160 SPI1P17947 270 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MC2RQ01718 297 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PCGF3Q3KNV8 242 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 GLB1L2Q8IW92 636 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 HHIPL1Q96JK4 782 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MTFP1Q9UDX5 166 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ZNF175Q9Y473 711 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 A0A1B0GVT2 93 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 P2RX6O15547 441 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CPMP14384 443 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CBR1P16152 277 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 DRD3P35462 400 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 EFNB2P52799 333 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SORDQ00796 357 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 GUCA2AQ02747 115 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 GAS6Q14393 721 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 LIN54Q6MZP7 749 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 USP53Q70EK8 1073 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 TMEM52Q8NDY8 209 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 TMEM185AQ8NFB2 350 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 GAL3ST3Q96A11 431 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ZNF254O75437 659 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 UPK3AO75631 287 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CT62P0C5K7 136 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ACHEP22303 614 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 AK4P27144 223 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 IGSF11Q5DX21 431 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 TSSK4Q6SA08 328 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MTSS1LQ765P7 747 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PXT1Q8NFP0 134 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 OR6N1Q8NGY5 312 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 HSPA12BQ96MM6 686 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 C12orf57Q99622 126 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 DUSP22Q9NRW4 184 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa10□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 A0A1B0GTH9 108 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PON3Q15166 354 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 COX18Q8N8Q8 333 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 FGF13Q92913 245 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 NKD1Q969G9 470 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SMIM10Q96HG1 83 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MFFQ9GZY8 342 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 RASL12Q9NYN1 266 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MBD2Q9UBB5 411 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ADH1AP07327 375 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 MGAT2Q10469 447 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 FAM53BQ14153 422 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 DEFB134Q4QY38 66 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CCDC157Q569K6 752 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 RASD2Q96D21 266 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 HDAC8Q9BY41 377 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SLITRK2Q9H156 845 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 PTPRSQ13332 1948 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 COL4A2P08572 1712 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 OR14I1A6ND48 311 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 XRCC3O43542 346 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 CEBPBP17676 345 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 LTBQ06643 244 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 IRF4Q15306 451 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SMARCD2Q92925 531 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 LRFN5Q96NI6 719 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 EXO5Q9H790 373 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 DAPP1Q9UN19 280 aa9.99□□□□□ -0.81
SCN4B-203ENST00000423160 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms