RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-HP01893 362 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHA3P29320 983 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRPRP30550 384 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BST1Q10588 318 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSG1Q2KHT4 349 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAAR8Q969N4 342 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS33AQ96AX1 596 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM186Q96B77 213 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYSFO75923 2080 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM157AC9JC47 383 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WIPF1O43516 503 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A3O75751 556 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFP02787 698 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPXP02790 462 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD79AP11912 226 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDO1P14902 403 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACHEP22303 614 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLRXP35754 106 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCGB2A2Q13296 93 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARD17Q5XLA6 110 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UEVLDQ8IX04 471 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS10Q8TAM1 723 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF75AQ96N20 296 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT3Q9BQG1 590 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMND5AQ9H871 391 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GWA3 101 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC3O15379 428 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSMBP08118 114 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF35P13682 527 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALT1P15291 398 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBLP22681 906 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR2AP28223 471 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH3B1P43353 468 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC24CP53992 1094 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTG1P63261 375 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPP2Q14168 576 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REP15Q6BDI9 236 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF627Q7L945 461 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARM1Q86X55 608 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH5Q92781 318 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITCHQ96J02 903 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RACGAP1Q9H0H5 632 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.32□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB36O95755 333 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPRP00739 348 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAAP10253 952 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DOBP13765 273 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL8A2P25067 703 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAR1BP31321 381 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALK2Q01415 458 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGFQ07326 219 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FXNQ16595 210 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG10BQ5I7T1 473 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXNQ6DKJ4 435 aa11.31□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRP11Q86VZ4 500 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms