RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NUP205Q92621 2012 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JNG1 304 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HIDE1A8MVS5 230 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LDB3O75112 727 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA4FO95754 770 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LALBAP00709 142 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 IGHG1P01857 330 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DBHP09172 617 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MTHFD2P13995 350 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ARRB2P32121 409 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS5Q14953 304 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 STK11Q15831 433 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LIPIQ6XZB0 460 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ST8SIA2Q92186 375 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MYADMQ96S97 322 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 EMC7Q9NPA0 242 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 HCSTQ9UBK5 93 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 K7EPK0 472 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ANGPTL7O43827 346 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB1D1O95968 90 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB5P28074 263 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ECI1P42126 302 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GSK3AP49840 483 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ARG2P78540 354 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF74Q16587 644 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 AVPI1Q5T686 147 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 COX15Q7KZN9 410 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PXT1Q8NFP0 134 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR7D2Q96RA2 312 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 PRR18Q8N4B5 295 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 H3BML4 177 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 STMND1H3BQB6 276 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HEXAP06865 529 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CHRM4P08173 479 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SELENBP1Q13228 472 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 PRR22Q8IZ63 422 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MBOAT4Q96T53 435 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP21Q9H596 190 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MARCH5Q9NX47 278 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF266Q14584 549 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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