RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LILRB2Q8N423 598 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SPIN2AQ99865 258 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP21Q9H596 190 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP57Q9NU63 452 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PEX14O75381 377 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 UBL3O95164 117 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CLDN6P56747 220 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GX78 115 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 B4DXG7 233 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 F8W036 122 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC2A10O95528 541 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SBK2P0C263 348 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ICAM2P13598 275 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 EFNA3P52797 238 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 BLOC1S1P78537 153 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 FGF14Q92915 247 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 APC2O95996 2303 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CEACAM5P06731 702 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 BDKRB2P30411 391 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PCBD1P61457 104 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 VWA2Q5GFL6 755 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5T1Q8NG75 326 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFRSF10AO00220 468 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HSD17B8Q92506 261 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GIMAP5Q96F15 307 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 EMC3Q9P0I2 261 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC43A1O75387 559 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 FCGR2AP12318 317 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 MFAP5Q13361 173 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LIMS2Q7Z4I7 341 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF546Q86UE3 836 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1S1Q8NH92 325 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFSF12O43508 249 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ACTL6BO94805 426 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 BTG2P78543 158 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF225Q9UK10 706 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PADI1Q9ULC6 663 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GPLD1P80108 840 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CMIPQ8IY22 773 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 DPM1O60762 260 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ALOX12BO75342 701 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 MPEG1Q2M385 716 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SIAH3Q8IW03 269 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNDC15Q96J42 360 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 NELFAQ9H3P2 528 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM82A0PJX8 343 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GLCEO94923 617 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC35A1P78382 337 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SEC22AQ96IW7 307 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 MED16Q9Y2X0 877 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 P2RX6O15547 441 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms