RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CCDC126Q96EE4 140 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMIM14Q96QK8 99 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC29A1Q99808 456 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TSG101Q99816 390 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARHGDIGQ99819 225 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EBF4Q9BQW3 602 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MARCH5Q9NX47 278 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CD274Q9NZQ7 290 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FANCIQ9NVI1 1328 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM168BA1KXE4 195 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMCO2A6NFE2 343 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PPP1R2P9O14990 202 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CGAP01215 116 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FGGP02679 453 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GSTM3P21266 225 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC2A5P22732 501 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 STOMP27105 288 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DCKP27707 260 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RORAP35398 523 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GLP1RP43220 463 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RGRP47804 291 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UQCRFS1P47985 274 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NPBWR2P48146 333 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ACVR1Q04771 509 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DOC2AQ14183 400 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ATP6AP1Q15904 470 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C22orf42Q6IC83 251 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 REEP3Q6NUK4 255 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDC20BQ86Y33 519 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR2AP1Q8NGE2 309 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TEKT3Q9BXF9 490 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CWH43Q9H720 699 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AIG1Q9NVV5 245 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 QPCTLQ9NXS2 382 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VNN3Q9NY84 501 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AHSPQ9NZD4 102 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A0G2JLM5 398 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C12orf77C9JDV5 145 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SIRPB1O00241 398 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AIM2O14862 343 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AGPAT2O15120 278 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 POLR2MP0CAP2 368 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TUBG1P23258 451 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CMA1P23946 247 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDKN1BP46527 198 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RFX3P48380 749 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC11A1P49279 550 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DLX1P56177 255 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PAX5Q02548 391 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IRF8Q02556 426 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ITIH4Q14624 930 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CD177Q8N6Q3 437 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR9G1Q8NH87 305 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms