RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287263.8

RAB11FIP1-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP1, Length 6,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ATF6BQ99941 703 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NICN1Q9BSH3 213 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PIGMQ9H3S5 423 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FBXL4Q9UKA2 621 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR6C68A6NDL8 312 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SORT1Q99523 831 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 B3GALT4O96024 378 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SPI1P17947 270 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CCR7P32248 378 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CAMK2DQ13557 499 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF561Q8N587 486 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 UBAC2Q8NBM4 344 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DTD2Q96FN9 168 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR5M11Q96RB7 305 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MED20Q9H944 212 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 A0A0A6YYJ9 748 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SHC1P29353 583 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RPL29P47914 159 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR1D5P58170 312 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TMEM123Q8N131 208 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RSRP1Q9BUV0 290 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DUSP13Q9UII6 198 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CBLCQ9ULV8 474 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa13.4□□□□□ -0.26
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ANTXRLA6NF34 631 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ACOD1A6NK06 481 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ADAM23O75077 832 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RAF1P04049 648 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CLDN17P56750 224 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC7A9P82251 487 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TMEM239Q8WW34 195 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TRIB3Q96RU7 358 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 VAPAQ9P0L0 249 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 C1SP09871 688 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DAP3P51398 398 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 BRICD5Q6PL45 260 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR4K15Q8NH41 348 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SRRQ9GZT4 340 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 C1GALT1Q9NS00 363 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DCAF16Q9NXF7 216 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PTTG3PQ9NZH4 202 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TCHHQ07283 1943 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GABRR3A8MPY1 467 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CD46P15529 392 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ACHEP22303 614 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SELENOWP63302 87 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF750Q32MQ0 723 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CDH26Q8IXH8 852 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 BMFQ96LC9 184 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MROH6A6NGR9 719 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF724A8MTY0 619 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KITLGP21583 273 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HOXC8P31273 242 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ELLP55199 621 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ACKR1Q16570 336 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 Q3ZCU0 254 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR6V1Q8N148 313 aa13.39□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PMP2P02689 132 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SERTAD2Q14140 314 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LTB4RQ15722 352 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GPR148Q8TDV2 347 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLAMF8Q9P0V8 285 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NENFQ9UMX5 172 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DVL1O14640 695 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 B4GALT3O60512 393 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NDUFB2O95178 105 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OXA1LQ15070 435 aa13.38□□□□□ -0.27
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TMEM135Q86UB9 458 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms