RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 GLCEO94923 617 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BMP1P13497 986 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB8P26012 769 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC5LQ9BPX5 153 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC19A3Q9BZV2 496 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 C4AP0C0L4 1744 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TRABD2BA6NFA1 517 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW12Q6X9E4 464 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 AGBL5Q8NDL9 886 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BBS1Q8NFJ9 593 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP22Q9NRW4 184 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CHD4Q14839 1912 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MSL3P1P0C860 447 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN17P56750 224 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BTG1P62324 171 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 STK11Q15831 433 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LPCAT3Q6P1A2 487 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SDSLQ96GA7 329 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT9Q9HCQ5 603 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LYRM4Q9HD34 91 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 GFYI3L273 518 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NPSR1Q6W5P4 371 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF836Q6ZNA1 936 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 AAED1Q7RTV5 226 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MCRIP1C9JLW8 97 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LGI1O95970 557 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NAGAP17050 411 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CPT2P23786 658 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 RPS19P39019 145 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CATR1Q13166 79 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 HTR4Q13639 388 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MEP1BQ16820 701 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 AFMIDQ63HM1 303 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 METRNLQ641Q3 311 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PGAP1Q75T13 922 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CHST8Q9H2A9 424 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SYT14P1Q58G82 188 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC51BQ86UW2 128 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LYSMD1Q96S90 227 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOIQ9C0D9 397 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ACER3Q9NUN7 267 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 A8MVM7 634 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF610Q8N9Z0 462 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC5Q8TCV5 224 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FAM3DQ96BQ1 224 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 OBP2AQ9NY56 170 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQK1 487 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 IGHEP01854 428 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 BTN1A1Q13410 526 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HMGN3Q15651 99 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CD276Q5ZPR3 534 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZTK2 550 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 FAM26EQ8N5C1 309 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF511Q8NB15 262 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OR10K1Q8NGX5 313 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2FQ969M7 185 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A46Q96AG3 418 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 EMC9Q9Y3B6 208 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2P2O95744 297 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CER1O95813 267 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SRMP19623 302 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DDOSTP39656 456 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 EIF1P41567 113 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SAXO2Q658L1 398 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OR51B6Q9H340 312 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GPR160Q9UJ42 338 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LRIT2A6NDA9 550 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RFXAPO00287 272 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ATP6P00846 226 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 WDR88Q6ZMY6 472 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 WDR5BQ86VZ2 330 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SEC22AQ96IW7 307 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TSSK2Q96PF2 358 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OBP2BQ9NPH6 170 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RAB22AQ9UL26 194 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 BIDP55957 195 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP6Q16828 381 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC18Q8N456 261 aa19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms