RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF626Q68DY1 528 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFS4O43181 175 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AKR7A3O95154 331 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OLFM2O95897 454 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EPPINO95925 133 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CRYBA1P05813 215 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CISD3P0C7P0 127 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FPR3P25089 353 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RORAP35398 523 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PRR5P85299 388 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FN3KQ9H479 309 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LHX6Q9UPM6 363 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 WDR45Q9Y484 360 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NPTNQ9Y639 398 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PATE3B3GLJ2 98 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 IDSB3KWA1 339 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ACOT7O00154 380 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PLPP2O43688 288 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HPP00738 406 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CNR1P21554 472 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FCARP24071 287 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MPIP34949 423 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 P2RX1P51575 399 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FOXK2Q01167 660 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LTB4RQ15722 352 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AVPI1Q5T686 147 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SPICQ8N5J4 248 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NUP43Q8NFH3 380 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR13H1Q8NG92 308 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PEX11GQ96HA9 241 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 S1PR5Q9H228 398 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EMC3Q9P0I2 261 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 KCNAB3O43448 404 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SRMP19623 302 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HTR2AP28223 471 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SHC2P98077 582 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EFNB1P98172 346 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ID2Q02363 134 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GUCA2AQ02747 115 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DMWDQ09019 674 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR7A5Q15622 319 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 KCTD9Q7L273 389 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LCN9Q8WX39 176 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR7D2Q96RA2 312 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CHST6Q9GZX3 395 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.94□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SELENOFO60613 162 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BMP8BP34820 402 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DLSTP36957 453 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MNDAP41218 407 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CLDN6P56747 220 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms