RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 MROQ9BYG7 248 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 INIPQ9NRY2 104 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 A0A087WUJ7 227 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 DIO1P49895 249 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 P2RX1P51575 399 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 SCGB2A2Q13296 93 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 OR8H3Q8N146 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 SULT1C4O75897 302 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 CBX7O95931 251 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 POC1BQ8TC44 478 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 RAB39BQ96DA2 213 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 EMC3Q9P0I2 261 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 HTR3BO95264 441 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 IDSB3KWA1 339 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 ADH6P28332 368 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 NR4A2P43354 598 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 AKR1C2P52895 323 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 NUDT6P53370 316 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 GNB2P62879 340 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 NUDT15Q9NV35 164 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 VDAC3Q9Y277 283 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 FCMRO60667 390 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 A0A0A6YYH2 397 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 A6NJ64 397 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 F10P00742 488 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 TLE3Q04726 772 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 GLO1Q04760 184 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 UCN3Q969E3 161 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 OPN1LWP04000 364 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 EMDP50402 254 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 LTC4SQ16873 150 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 VRK2Q86Y07 508 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 LRP3O75074 770 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM225BP0DP42 221 aa7.54□□□□□ -1.2
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