RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 J3QR89 54 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 KCNJ10P78508 379 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SPTSSAQ969W0 71 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SCLYQ96I15 445 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SCMH1Q96GD3 660 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 LINC00052Q96N35 136 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SERINC2Q96SA4 455 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 LRP5LA4QPB2 252 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 MAKP20794 623 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 AKR1C3P42330 323 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SLC14A2Q15849 920 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 CDONQ4KMG0 1287 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 GPR174Q9BXC1 333 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 TSPAN12O95859 305 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 CD37P11049 281 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 NPY4RP50391 375 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ATF6BQ99941 703 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 OR6C68A6NDL8 312 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FABP4P15090 132 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SLC6A8P48029 635 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 NAXDQ8IW45 347 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 APCDD1Q8J025 514 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PRO1933Q9H354 126 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 H0YIV9 168 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ZNF250P15622 560 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 EFNA3P52797 238 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 GBX1Q14549 363 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 CCNJQ5T5M9 372 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FXYD1O00168 92 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 JMJD7P0C870 316 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FAHD1Q6P587 224 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 DDIT4LQ96D03 193 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 WDFY2Q96P53 400 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 BCO1Q9HAY6 547 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FURINP09958 794 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 RRASP10301 218 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 EPHA4P54764 986 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 ERVK-16P61578 105 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 HAGHQ16775 308 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 OR1F2PQ96R84 312 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 UBQLN3Q9H347 655 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 M0R082 166 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 TCAPO15273 167 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 LILRB3O75022 631 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 TRAPPC6AO75865 159 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 SFTA3P0C7M3 94 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-201ENST00000256413 CTRB1P17538 263 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms