RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 LNX2Q8N448 690 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM5Q8N4H5 51 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT15Q9NV35 164 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GLOD5A6NK44 160 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FRS3O43559 492 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 STX11O75558 287 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SC5DO75845 299 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 RCBTB2O95199 551 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA7P01567 189 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SAGP10523 405 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP7P18075 431 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 EMP2P54851 167 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTC1P68032 377 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTA1P68133 377 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 HSF2Q03933 536 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TBR1Q16650 682 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC36A2Q495M3 483 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PLBD1Q6P4A8 553 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM255BQ8WV15 326 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMP4Q99727 224 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GLTPQ9NZD2 209 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KCMF1Q9P0J7 381 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF222Q9UK12 451 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX6Q9UPM6 363 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM5Q9Y2B1 443 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ARGFXA6NJG6 315 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALT2O43825 422 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 HEXBP07686 556 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SHC1P29353 583 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 MC3RP41968 323 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 OR11H7Q8NGC8 314 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD4Q8TB40 342 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TSLPQ969D9 159 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 HS6ST2Q96MM7 605 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF681Q96N22 645 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A4EQ96PG1 132 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SORCS2Q96PQ0 1159 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SERINC2Q96SA4 455 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52D1Q9H346 318 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 DAPP1Q9UN19 280 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNMB2Q9Y691 235 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHE40O14503 412 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CTDSPLO15194 276 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A10O95528 541 aa23.93■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 TFPIP10646 304 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 DYRK1AQ13627 763 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00303Q3SY05 128 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK4Q6UW60 755 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC43A2Q8N370 569 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FANK1Q8TC84 345 aa23.93■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 EVA1AQ9H8M9 152 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CMC2Q9NRP2 79 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 P4HTMQ9NXG6 502 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A7Q9UM01 511 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 BAIAP2Q9UQB8 552 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK10Q96BY6 2186 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JK05 382 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC13A5PLN9 417 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM127O75204 238 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CD63P08962 238 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 MAOAP21397 527 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 NRG3P56975 720 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 POU4F2Q12837 409 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FRRS1Q6ZNA5 592 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT74Q7RTS7 529 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM19Q7Z692 300 aa23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD1Q96SE0 405 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SMUG1Q53HV7 270 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 BTN2A1Q7KYR7 527 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK20Q8IZL9 346 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SPERTQ8NA61 448 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIKINA0A087WXM9 373 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRN3E7EW58 273 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFBR3LH3BV60 316 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CYR61O00622 381 aa23.91■■□□□ 1.42
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