RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ARR3P36575 388 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 MAGEA6P43360 314 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 C18orf63Q68DL7 685 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 GRINAQ7Z429 371 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.75□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.75□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RAB27BO00194 218 aa9.75□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC39A13Q96H72 371 aa9.74□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 NOX4Q9NPH5 578 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TREX1Q9NSU2 369 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.74□□□□□ -0.85
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TRPS1-201ENST00000220888 CACNG2Q9Y698 323 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.74□□□□□ -0.85
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