RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637923.2

TCF4-288, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 7,314 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-288	ENST00000637923	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	AGPAT2	O15120	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SLC19A2	O60779	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	TOX4	O94842	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	HOXB5	P09067	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	GM2A	P17900	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SDC1	P18827	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CAPN3	P20807	821 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	DRD5	P21918	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ASCL1	P50553	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	KCNJ10	P78508	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	PLAUR	Q03405	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	NMES1	Q9C002	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZNF205	O95201	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SLC34A2	O95436	690 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SNAP29	O95721	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	EVI2B	P34910	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CCR2	P41597	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CLDN8	P56748	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CLDN1	O95832	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	GABRG2	P18507	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	TRAM1	Q15629	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	EXTL1	Q92935	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	TK1	P04183	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	LIM2	P55344	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	FEV	Q99581	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-288	ENST00000637923	BTAF1	O14981	1849 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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