RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MORN4	Q8NDC4	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	FMO2	Q99518	471 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	KLF11	O14901	512 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RIPK2	O43353	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SHBG	P04278	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	C2	P06681	752 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	STMN1	P16949	149 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	AGTR1	P30556	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	STX2	P32856	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN20	P56880	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NAB1	Q13506	487 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SGCB	Q16585	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	EXT2	Q93063	718 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768		A0A096LPK6	155 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0G2JN53	185 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	OR1F1	O43749	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	KERA	O60938	352 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	ABHD2	P08910	425 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	FCGR2A	P12318	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	CHN1	P15882	459 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MLH1-223	ENST00000616768	PTAFR	P25105	342 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms