RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	NUDT14	O95848	222 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	GRK6	P43250	576 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	POU4F2	Q12837	409 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	CCIN	Q13939	588 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	MED28	Q9H204	178 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	NANS	Q9NR45	359 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	SC5D	O75845	299 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	FOXL2	P58012	376 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	CTXN1	P60606	82 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	TSLP	Q969D9	159 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SMTN-222	ENST00000612341	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	FCER2	P06734	321 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	GAA	P10253	952 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ITPKB	P27987	946 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	GZMK	P49863	264 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	DIO1	P49895	249 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ACTA2	P62736	377 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ACTG2	P63267	376 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	RIN1	Q13671	783 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	TRAM1	Q15629	374 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF141	Q15928	474 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	CEP76	Q8TAP6	659 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	DCTN6	O00399	190 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	FABP7	O15540	132 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	OR2B3	O76000	313 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	PDGFA	P04085	211 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	BTC	P35070	178 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	BLK	P51451	505 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	GDF15	Q99988	308 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1W2PPC4	97 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	C11orf98	E9PRG8	122 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341		I3L521	148 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINA3	P01011	423 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	CD1C	P29017	333 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	RAB30	Q15771	203 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	YIPF5	Q969M3	257 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	RAD1	O60671	282 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ZFPL1	O95159	310 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	MYF5	P13349	255 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	SRM	P19623	302 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SMTN-222	ENST00000612341	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53

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