RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	NUAK2	Q9H093	628 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ROS1	P08922	2347 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CTDSP2	O14595	271 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACP2	P11117	423 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	HTR2B	P41595	481 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDC42	P60953	191 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDE7A	Q13946	482 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	IRF3	Q14653	427 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CEBPE	Q15744	281 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDS1	Q92903	461 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAB8B	Q92930	207 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GADD45G	O95257	159 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLDN1	O95832	211 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ITGA2	P17301	1181 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	BIK	Q13323	160 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	DCST1	Q5T197	706 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR4C3	Q8NH37	302 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	MED11	Q9P086	117 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.33	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCNB2	O95067	398 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GAST	P01350	101 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CHM	P24386	653 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GHDC	Q8N2G8	530 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPAS1	Q99742	590 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CBLC	Q9ULV8	474 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A0G2JPF8	293 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TP53I11	O14683	189 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTGDS	P41222	190 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNJ5	P48544	419 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DUSP7	Q16829	419 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882		Q8NFD4	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	HGD	Q93099	445 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GLRX2	Q9NS18	164 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	FRG2C	A6NGY1	282 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACOT7	O00154	380 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCRL2	O00421	344 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	RGS5	O15539	181 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYP7B1	O75881	506 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SOX14	O95416	240 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DRD5	P21918	477 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CBL	P22681	906 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CARD18	P57730	90 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	RBBP4	Q09028	425 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SSX1	Q16384	188 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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