RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 COL4A2P08572 1712 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 NAV3Q8IVL0 2385 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPOAP1O95153 1857 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM89A2RUT3 159 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 C19orf71A6NCJ1 209 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 E9PMD0 336 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 H0YJW9 148 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SGK494L7N484 410 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 MANBAO00462 879 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRKYO43930 277 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 UGT1A9O60656 530 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 STX11O75558 287 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 UGT2B17O75795 530 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRIM16O95361 564 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 GKN3PP0CG01 181 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 VCLP18206 1134 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBXA2RP21731 343 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHMT2P34897 504 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 RFC4P35249 363 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC6A8P48029 635 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERFP50548 548 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRKXP51817 358 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMSP52788 366 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPS14P62263 151 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CTAG1AP78358 180 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 RIPK1Q13546 671 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CUL1Q13616 776 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 GINS1Q14691 196 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC9A3R2Q15599 337 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADPRMQ3LIE5 342 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 BCL7AQ4VC05 210 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM69Q5SWH9 247 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CFAP58Q5T655 872 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF470Q6ECI4 717 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCYL2Q6P3W7 929 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT74Q7RTS7 529 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRSS42Q7Z5A4 293 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TUSC5Q8IXB3 177 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC191Q8NCU4 936 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF563Q8TA94 476 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CNIH3Q8TBE1 160 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABHD3Q8WU67 409 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHC3Q92529 594 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PHYHIPQ92561 330 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAGE5Q96GU1 130 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ITCHQ96J02 903 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBL1YQ9BQ87 522 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEC22CQ9BRL7 303 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 OSBPL8Q9BZF1 889 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMYD3Q9H7B4 428 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 UGT1A7Q9HAW7 530 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 UGT1A10Q9HAW8 530 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 UGT1A8Q9HAW9 530 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ISYNA1Q9NPH2 558 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ASF1BQ9NVP2 202 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEPT10Q9P0V9 454 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADGRB3O60242 1522 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF860A6NHJ4 632 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM74A7A6NL05 159 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 VSTM2BA6NLU5 285 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 H7C417 338 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCER2I3L3R5 266 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 MFNGO00587 321 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 STAMBPO95630 424 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 FSTL3O95633 263 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ALDOBP05062 364 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSF3P09919 207 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 UROSP10746 265 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CMA1P23946 247 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 BDKRB1P46663 353 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PITPNBP48739 271 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 SRP54P61011 504 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 NTHL1P78549 312 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB40BQ12829 278 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 NME3Q13232 169 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 BIKQ13323 160 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 PARP15Q460N3 678 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZBED5Q49AG3 693 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM74A3Q4VXF1 159 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPP7Q5T2T1 576 aa-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms