RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 MYL9P24844 172 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 MTPNP58546 118 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 RELBQ01201 579 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PMS2P11Q13670 270 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PLAC9Q5JTB6 97 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 LRRC73Q5JTD7 316 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 MSRB3Q8IXL7 192 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 FAR1Q8WVX9 515 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TMEM234Q8WY98 164 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 FAM46BQ96A09 425 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PTCHD1Q96NR3 888 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SLC46A1Q96NT5 459 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 MESP1Q9BRJ9 268 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 DPY30Q9C005 99 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 OAZ3Q9UMX2 235 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ING4Q9UNL4 249 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 LEFTY1O75610 366 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CTSLP07711 333 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HOXB2P14652 356 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HIST1H2ADP20671 130 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ABCD3P28288 659 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PMELP40967 661 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CDK6Q00534 326 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 FPGSQ05932 587 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 IMPG1Q17R60 797 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 BSXQ3C1V8 233 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 REEP3Q6NUK4 255 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 DET1Q7L5Y6 550 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CFAP206Q8IYR0 622 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SMIM12Q96EX1 92 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 FCRL1Q96LA6 429 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 HIST1H2AJQ99878 128 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 H2AFJQ9BTM1 129 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ALG8Q9BVK2 526 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 LGR4Q9BXB1 951 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CHST5Q9GZS9 411 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ACTR8Q9H981 624 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 RAD18Q9NS91 495 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GV72 72 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PTGES3LE9PB15 166 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TLR4O00206 839 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 UPK1AO00322 258 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ZNF749O43361 778 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TPST1O60507 370 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 RAMP3O60896 148 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SLC35E2P0CK97 266 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 GATA4P43694 442 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PFN3P60673 137 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 C2orf80Q0P641 193 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ENPP2Q13822 863 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SLC17A1Q14916 467 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PYCR3Q53H96 274 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CASP12Q6UXS9 341 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 Q6ZVL8 140 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ASB5Q8WWX0 329 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 MYLIPQ8WY64 445 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SCAMP4Q969E2 229 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PRRC1Q96M27 445 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 ADI1Q9BV57 179 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SLITRK2Q9H156 845 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-244ENST00000602516 SERHLQ9NQF3 203 aa6.99□□□□□ -1.29
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