RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 AHSA1O95433 338 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 CRYAAP02489 173 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IL6P05231 212 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IDO1P14902 403 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SRD5A1P18405 259 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 RPS5P46782 204 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 CLDN17P56750 224 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 COPZ1P61923 177 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 EFNB3Q15768 340 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZNF385DQ9H6B1 395 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SAR1AQ9NR31 198 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 CALML5Q9NZT1 146 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 RASD1Q9Y272 281 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 A0A096LPI6 279 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 LRP5LA4QPB2 252 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 NDUFS8O00217 210 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 FZD7O75084 574 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SEC14L2O76054 403 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 PDE5AO76074 875 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 VAMP5O95183 116 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ANP32DO95626 131 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IGKV3-15P01624 115 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 BMP2P12643 396 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 HTR2AP28223 471 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IL2RGP31785 369 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ATP4BP51164 291 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ARF1P84077 181 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 C6orf10Q5SRN2 563 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 C10orf111Q8N326 155 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SVOPLQ8N434 492 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 STK35Q8TDR2 534 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 GTF2H4Q92759 462 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SLC52A3Q9NQ40 469 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 RCE1Q9Y256 329 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 A0A0G2JPF8 293 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 OR6C65A6NJZ3 312 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 B9A039 149 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 M0R082 166 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 CCDC22O60826 627 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZNF23P17027 643 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 THBS4P35443 961 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 PPOXP50336 477 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 STX1BP61266 288 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 NPRL3Q12980 569 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SQLEQ14534 574 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MSMPQ1L6U9 139 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 SLC2A7Q6PXP3 512 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MDP1Q86V88 176 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 FUNDC1Q8IVP5 155 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 WDFY1Q8IWB7 410 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 TMEM123Q8N131 208 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MIER2Q8N344 545 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 NUP37Q8NFH4 326 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ITCHQ96J02 903 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 OR2M2Q96R28 347 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 NOX3Q9HBY0 568 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 GPR35Q9HC97 309 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.47□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GWA3 101 aa10.47□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 TMEM129A0AVI4 362 aa10.47□□□□□ -0.73
CTIF-208ENST00000590422 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms