RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 GRK5P34947 590 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 CAPZA2P47755 286 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 DNASE1L1P49184 302 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 DAPP51397 102 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 CARD18P57730 90 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 CXCR4P61073 352 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 CXADRP78310 365 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 RBPJQ06330 500 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FOXF1Q12946 379 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SEC23BQ15437 767 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SLC36A3Q495N2 470 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ARSKQ6UWY0 536 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PXKQ7Z7A4 578 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 COMTD1Q86VU5 262 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 P3H2Q8IVL5 708 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 OR8H2Q8N162 312 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FANK1Q8TC84 345 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 NRG4Q8WWG1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL15Q96M94 604 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SNX18Q96RF0 628 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PITX2Q99697 317 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SLC29A1Q99808 456 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FN3KQ9H479 309 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PROK2Q9HC23 129 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FANCFQ9NPI8 374 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL1Q9NR64 748 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 CLN6Q9NWW5 311 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 EMC3Q9P0I2 261 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 MPDZO75970 2070 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GVC2 190 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PNV4 684 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 LIPT2A6NK58 231 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZAR1LA6NP61 321 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS47A8MTI9 375 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AHRRA9YTQ3 701 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AQP7O14520 342 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PTP4A3O75365 173 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TNFAIP8O95379 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SNAP29O95721 258 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CH25HO95992 272 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IGHG3P01860 377 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CD14P08571 375 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GABRA1P14867 456 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF3P17036 446 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ENPP1P22413 925 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MYF6P23409 242 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 POU1F1P28069 291 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GGT2P36268 569 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IST1P53990 364 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AQP4P55087 323 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CDK5Q00535 292 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MYBPC1Q00872 1141 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PUDPQ08623 228 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MYBPHQ13203 477 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RAPSNQ13702 412 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms