RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 HPGDP15428 266 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS7P62081 194 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTA2P62736 377 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTG2P63267 376 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SKP2Q13309 424 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL10Q6ZVT0 673 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB18Q6ZVZ8 466 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A15Q8N5U1 240 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf47Q8NEP4 570 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ADIPOR1Q96A54 375 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 TPK1Q9H3S4 243 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 MED20Q9H944 212 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCB9Q9NP78 766 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 NRIP3Q9NQ35 241 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 TCFL5Q9UL49 500 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTBP11277 2137 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF264O43296 627 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 DDAH2O95865 285 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC2LP0C7M8 214 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 FBLP22087 321 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 MXD1Q05195 221 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SCN1BQ07699 218 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF79Q15937 498 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBP7Q16270 282 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10H4Q8NGA5 316 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5W2Q8NH69 310 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF721Q8TF20 911 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SMPDL3BQ92485 455 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SOSTQ9BQB4 213 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51V1Q9H2C8 321 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF304Q9HCX3 659 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC19A2O60779 497 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 UTS2O95399 124 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOA3BQ3SY89 546 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM69BQ5VUD6 431 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM91Q6ZNR0 172 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 GDPD3Q7L5L3 318 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOA3Q8NG57 546 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5M3Q8NGP4 307 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED9Q9BVK6 235 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 MFRPQ9BY79 579 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 POLE4Q9NR33 117 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SRPK3Q9UPE1 567 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HIF3AQ9Y2N7 669 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GX78 115 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 FABP12A6NFH5 140 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA3P01011 423 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF85Q03923 595 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ASAH1Q13510 395 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8H2Q8N162 312 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PLPP5Q8NEB5 264 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 DDOQ99489 341 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PTNP21246 168 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 DIO1P49895 249 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A1P53007 311 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CHAF1BQ13112 559 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 EMC4Q5J8M3 183 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM131AQ6UXB0 335 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP41Q8N8Y5 198 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT14Q8NB59 555 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PHYHIPQ92561 330 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 DIRAS2Q96HU8 199 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD61A6NGH8 418 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ARGFXA6NJG6 315 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TXNDC12O95881 172 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 IL7P13232 177 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 NRG3P56975 720 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PON3Q15166 354 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ATF6BQ99941 703 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HDHD5Q9BXW7 423 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TGIF2Q9GZN2 237 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D24Q9ULP9 559 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 MAU2Q9Y6X3 613 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OGG1O15527 345 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM127O75204 238 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 REM1O75628 298 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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