RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MOKQ9UQ07 419 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JN53 185 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 HMX3A6NHT5 357 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 FAM227AF5H4B4 570 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CTSVO60911 334 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 TACSTD2P09758 323 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 UBL4AP11441 157 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 IFI30P13284 250 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CASP3P42574 277 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 HTR3AP46098 478 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CAPZBP47756 277 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 SEPHS1P49903 392 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CAPZA1P52907 286 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ATP12AP54707 1039 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 TPTEP56180 551 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 NRG3P56975 720 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 AP3S2P59780 193 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 HHEXQ03014 270 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GPR68Q15743 365 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ZFP69Q49AA0 526 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 PYDC2Q56P42 97 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 FCRL6Q6DN72 434 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C22orf42Q6IC83 251 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 DESI1Q6ICB0 168 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 OAFQ86UD1 273 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 RDH10Q8IZV5 341 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 AMER3Q8N944 861 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 SYT14Q8NB59 555 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 OR10G6Q8NH81 332 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GRHL3Q8TE85 626 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 LIPHQ8WWY8 451 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 HTRA1Q92743 480 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 MBD6Q96DN6 1003 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 DGAT2Q96PD7 388 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ALG8Q9BVK2 526 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 IFT27Q9BW83 186 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ING3Q9NXR8 418 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 METRNQ9UJH8 293 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 VWFP04275 2813 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 FITM1A5D6W6 292 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CENPBD1B2RD01 187 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C4orf51C9J302 202 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GABRPO00591 440 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CTDSP2O14595 271 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 RNF13O43567 381 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 FGF17O60258 216 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 FCMRO60667 390 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V1G1O75348 118 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 SLC43A1O75387 559 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 KCNK2O95069 426 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CLDN14O95500 239 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 YES1P07947 543 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 NGFRP08138 427 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CYC1P08574 325 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 MSL3P1P0C860 447 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 PRG2P13727 222 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 HPGDP15428 266 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CELP19835 753 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C4BPBP20851 252 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GABRA3P34903 492 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 GPR4P46093 362 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 MAP2K3P46734 347 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 RFX3P48380 749 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 TGM4P49221 684 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 EVX1P49640 407 aa7.32□□□□□ -1.24
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