RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573498.5

SRRM2-215, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 3

Gene SRRM2, Length 994 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-215	ENST00000573498	BDKRB1	P46663	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ZNF84	P51523	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CRADD	P78560	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CDK16	Q00536	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ZNF154	Q13106	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TAF11	Q15544	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498		Q6ZT83	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CSF3R	Q99062	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	RHBG	Q9H310	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PAK5	Q9P286	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498		A0A1B0GW55	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498		A0A1W2PPM1	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PSMD3	O43242	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SEC14L5	O43304	696 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	EPO	P01588	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	OR4A8	P0C604	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	COX5A	P20674	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PAX7	P23759	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	COL8A2	P25067	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CCR7	P32248	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ADRA1A	P35348	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PTGDS	P41222	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	MAGEA3	P43357	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	CLDN20	P56880	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PRAME	P78395	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	LCN2	P80188	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	BST1	Q10588	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	NAB1	Q13506	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TMED2	Q15363	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SEC23B	Q15437	767 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRRM2-215	ENST00000573498	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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