RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		19.03	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	NELFA	Q9H3P2	528 aa		19.03	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		19.03	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		19.03	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	JMJD1C	Q15652	2540 aa		19.03	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6G6D	O95868	133 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	NPPA	P01160	153 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	THY1	P04216	161 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	HEXA	P06865	529 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	TTK	P33981	857 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	GUCY1A3	Q02108	690 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	ETFDH	Q16134	617 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM123	Q8N131	208 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	19.02	■□□□□ 0.64
PPP4C-205	ENST00000563200	CHP2	O43745	196 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFS7	O75251	213 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT11	O96014	354 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-39	P01824	125 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PTN	P21246	168 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CBL	P22681	906 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	19.01	■□□□□ 0.63	1e-6	■■■■□ 26
PPP4C-205	ENST00000563200	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP6	Q5VW22	663 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	REP15	Q6BDI9	236 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF217	Q8TC41	542 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2M2	Q96R28	347 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG2	Q9H553	416 aa		19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRN3	E7EW58	273 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC43A1	O75387	559 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DOB	P13765	273 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	TNK1	Q13470	666 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3GL1	Q99961	368 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MRAS	O14807	208 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF544	Q6NX49	715 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX32	Q86XE0	403 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC15	Q8N387	334 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF583	Q96ND8	569 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR35	Q9HC97	309 aa		19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA1	O95477	2261 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPP3	O14495	311 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT34	O76011	436 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX7	P23759	505 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	VEZF1	Q14119	521 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPRE2	Q15555	327 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MMEL1	Q495T6	779 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	UEVLD	Q8IX04	471 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPN	Q9BXN1	380 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	FKRP	Q9H9S5	495 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	USP22	Q9UPT9	525 aa		18.99	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A096LPE4	126 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPZ6	126 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-ATP6	P00846	226 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ACVR1B	P36896	505 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PUDP	Q08623	228 aa		18.98	■□□□□ 0.63
PPP4C-205	ENST00000563200	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		18.98	■□□□□ 0.63

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