RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	IL2RG	P31785	369 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	SERPINF1	P36955	418 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	PPOX	P50336	477 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	PDLIM4	P50479	330 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	UFM1	P61960	85 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	RIN1	Q13671	783 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	CEACAM7	Q14002	265 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM166A	Q6J272	317 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF627	Q7L945	461 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	AAED1	Q7RTV5	226 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM123	Q8N131	208 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC35B4	Q969S0	331 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	C3orf49	Q96BT1	292 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	DDIT4L	Q96D03	193 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	PNPO	Q9NVS9	261 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	RCE1	Q9Y256	329 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC7B-210	ENST00000556749		A0A096LPI6	279 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	GSN	P06396	782 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	GPI	P06744	558 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	C8B	P07358	591 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	CELA3B	P08861	270 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	PNMT	P11086	282 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF35	P13682	527 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	IL7R	P16871	459 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	S100A3	P33764	101 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	THBS4	P35443	961 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	EVX1	P49640	407 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	GYS2	P54840	703 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	TUBA1B	P68363	451 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	TUBA4A	P68366	448 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	BST1	Q10588	318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	BNIP2	Q12982	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	SQLE	Q14534	574 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	OR7A5	Q15622	319 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	CHI3L2	Q15782	390 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF124	Q15973	351 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	CR1L	Q2VPA4	569 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	TTMP	Q5BVD1	217 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	TUBA1A	Q71U36	451 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	COMTD1	Q86VU5	262 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF786	Q8N393	782 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC7B-210	ENST00000556749	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.9	□□□□□ -1.79

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